旋風分離消泡器是將發酵罐內產生的泡沫由排氣管引入到罐外的旋風分離器中，氣流受導向葉片的導流作用而產生強烈旋轉，氣流沿筒體呈螺旋形向下進入旋風簡體，密度大的泡沫和液滴被甩向壁面，并且在重力的作用下，通過旋風分離器壁面下落到罐內，氣體則由旋風分離器上部流出，其氣液分離效率高，能夠有效的防止工業發酵過程中的逃液。旋風分離消泡器結構見圖4。

一般來說，工業常用的機械消泡方式不能從根本上消除引起泡沫產生的因素，并且泡沫量過大時，不能迅速的消除泡沫，因此在生產中常常起到一個輔助的消泡效果，往往配合化學消泡劑一起使用。另外，機械消泡器容易產生死角導致滅菌不徹底。但是，機械消泡器也具有巨大的優勢，某廠運用了一種高效消泡裝置用于谷氨酸發酵泡沫控制，它由耙式消泡槳和旋風分離式消泡器構成。通過5#，6#發酵罐安裝使用，泡敵的使用量由原來的7‰下降為4.5‰，發酵罐裝液量也提高到了72.5％。僅泡敵一項就節約了20元/t。