發酵過程中一般是通過化學消泡劑控制泡沫的產生。消泡劑分散在培養基中形成穩定的液膜，進而提高排水速率并促進氣泡的聚集。影響消泡劑作用的主要關鍵因素有以下3 個:

( 1) 液體消泡劑必須要有一定的不溶性。

( 2) 消泡劑必須要有較大的分散系數，能在培養基中迅速鋪展。而且具有較低的表面張力。

( 3) 疏水分子要作用在特定的氣泡接觸角，因此顆粒要有合適的大小和形狀，使得消泡劑液滴能夠穿透氣泡。

消泡劑必須要具有比穩定泡沫的表面活性劑更強的表面活性。以此進入到能夠形成泡沫的液體當中并迅速在氣液界面鋪展。形成的混合表面活性層進一步阻止原液中分子的緊密結合。消泡劑的消泡效率依賴于其在液體中的擴散能力和滲透泡沫的能力。具體公式為:

滲透系數E: E =σl－ σd + σint;

鋪展系數S: S = σl－ σd－ σint

( σl: 發酵液的表面張力;

σd: 消泡劑的表面張力;

σint: 消泡劑與發酵液之間的界面張力)

當E＞0 時，消泡劑液滴能夠穿透泡沫以消泡;當S＞0 時，消泡劑能夠自動的在液體表層鋪展。因此消泡劑的消泡效率與表面張力( 或者是界面張力) 有關，表面張力降低，消泡劑的消泡效率增高。

當然，消泡劑中包含活性成分。另外消泡劑的粘度也會影響到消泡效率，一般是低濃度的消泡劑鋪展系數和滲透系數較高。